竺可桢在东南大学创建了中国第一个地学系,设有地理、气象、地质、矿产四个专业。
竺可桢回国后,不受官职厚禄,先受聘到武昌高等师范学校讲授地理和天文气象课。他自编讲义,内容新颖、丰富,体现了当时最先进的地理和气象学说,还在课外带领学生参观实习,深得同学爱戴。1920年秋,竺可桢改至南京高等师范学校,讲授气象学、地理学等。1921年竺可桢任地学系主任。1923年担任中国气象学会首届理事。1925年担任中国气象学会首届副会长等职。1927年重返东南大学任地学系主任。期间曾受中国科学社派遣,至东京出席第三届泛太平洋科学会议。1928年应中央研究院蔡元培院长之聘,在南京北极阁筹建气象研究所,辞去中央大学地学系主任职务,任气象研究所所长。出版了所著的中国第一本近代(气象学类书籍)《气象学》。直到1946年8月,才辞去气象所所长职务。